Inférence de modèles en marche aléatoire de gènes sur des graphes socioécologiques pour prédire la réponse des espèces aux changements environnementaux

Encadrement: Stéphane Dupas

Equipe: DEEIT

Description du sujet:

Le stage s’intègre dans les travaux démogénétique environnementale et sociale au sein de l’équipe DEEIT qui visent à intégrer les données de génétique des populations et des informations environnementales ou sociales sur les réseaux d’échange de gène pour inférer des modèles de dynamique de la biodiversité permettant d’établir des scénarios sur son devenir. Le stagiaire mettra en forme une bibliothèque de fonctions existantes ou en construction pour inférer les paramètres de ces modèles bayésiens et bayésiens approximés de marche aléatoire sur des graphes appliquée à ces questions. Nous utiliserons les données du projet InSPRed qui s’intéresse aux scénarios de réponse des insectes ravageurs du maïs au Kenya aux changements climatiques et sociétaux.

Période: 2016

Durée: 3 mois

Niveau: M1

Formation recherchée: Écologie, génétique, modélisation, bioinformatique, statistiques

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