Nos thématiques de recherche s’inscrivent dans le cadre de l’évolution du génome et les interactions qui s’y développent. Elles se concentrent principalement sur l’étude des séquences génétiques mobiles, et notamment des éléments transposables (ET), leur dynamique et leur impact dans les génomes et les populations. Les principaux thèmes abordés sont :

– l’évolution des éléments mobiles, incluant l’analyse de leur diversité, l’identification des facteurs (génomiques ou externes) influençant leur activité (niveau d’expression et niveau de transposition), l’évolution de la structure générale des éléments transposables (et de leur proteines), la classification des éléments.

– L’impact des éléments transposables sur les génomes, et en particulier, le rôle de ET dans les transferts lateraux de gènes, la dynamique d’invasion des génomes et des populations par un élément transposable suite à un transfert horizontal (ou une migration), les interactions entre éléments autonomes et non autonomes.

– L’évolution des génomes et des systèmes biologiques : les interactions entre gènes vont déterminer les caractères. La sélection phénotypique va agir sur les génomes. Par des approches expérimentales et théoriques, nous cherchons à comprendre comment des systèmes biologiques complexes se sont mis en place, fonctionnent et évoluent.

Les approches utilisées sont principalement moléculaires et bioinformatiques. L’approche biologique utilise comme modèle la drosophile (Drosophila melanogaster ou D. simulans), et l’élément transposable mariner. Les approches bioinformatiques nous permettent de développer les outils nécessaires à l’analyse des génomes, aux simulations de populations

Mots clés : Eléments transposables, transposons ADN mariner, Drosophila melanogaster, Drosophila simulans, génomique, dynamique évolutive, évolution moléculaire