Des mécanismes mutationnels variés génèrent de nouvelles copies des gènes présents dans les génomes. Ils peuvent aussi en éliminer. Il se constitue ainsi des familles multigéniques dont les effectifs peuvent être très dynamiques.

Nous nous intéressons au devenir de familles de gènes en relation avec :

* Leur recrutement dans de nouvelles fonctions;
* Les pertes de fonctions;
* Les processus adaptatifs dans lesquels elles peuvent être impliquées.

Deux axes majeurs de recherche sont développés autour de cette thématique générale :

* L’évolution moléculaire et fonctionnelle de facteurs de transcription impliqués dans le développement des vertébrés;
* L’adaptation moléculaire d’enzymes digestives chez les métazoaires.

L’équipe s’attache à comprendre les processus d’émergence et de différenciation des espèces en développant des approches intégrées : de l’étude biogéographique à celle de l’évolution du génome, du transcriptome et du protéome. Un autre thème concerne ces molécules produites par la cuticule qui servent à chacun des partenaires sexuels à se reconnaître et qui sont appelées phéromones. Enfin, des éléments génétiques qui modifient l’équilibre des sexes chez la drosophile sont également étudiés.

Quelques questions parmi celles que nous abordons :

* Pourquoi certaines espèces de drosophiles restent cantonnées dans leur zone d’origine, parfois très limitée, quand d’autres sont capables de coloniser des zones géographiques très étendues et écologiquement diversifiées ?
* Quelles sont les bases génétiques de l’isolement post-zygotique (stérilité/inviabilité des hybrides) ?
* Est-il avant tout le résultat d’un dérèglement de l’expression génique ?

Les recherches de l’équipe sur l’abeille se développent selon trois pôles principaux qui sont en forte interaction : génomique, étude des populations naturelles (phylogéographie, écotypes, structure fine des populations), et comportements.

Parmi les thématiques principales, figurent :

* L’établissement d’une carte génétique de l’abeille (comportant actuellement 1500 marqueurs);
* La caractérisation de QTL;
* L’étude de la biodiversité de l’abeille en France et en Europe avec la mise en place de conservatoires;
* L’étude de l’isolement reproducteur chez un écotype;
* L’étude de l’adaptation comportementale des abeilles vis-à-vis des attaques visant la colonie, en particulier les réactions de défense contre les frelons;
* L’étude des phénomènes de perception, d’apprentissage et de mémoire olfactifs et visuels des abeilles.

Ces thématiques ont en commun d’utiliser des marqueurs moléculaires et la génétique.

L’évolution de l’activité des éléments transposables; l’identification des facteurs de l’hôte (extra-élément) et de l’élément lui-même (structure et séquence) susceptibles de modifier cette activité; la dynamique d’invasion d’un élément suite à un transfert horizontal ou à une genèse de novo ainsi que l’évolution de la structure générale des éléments transposables sont les principaux thèmes de cette équipe.

Cela nous permet d’aborder, entre autres, la transmission de facteurs non génétiques d’une génération à la suivante par la voie maternelle. Enfin, nos travaux sur l’évolution de la structure générale des éléments transposables devraient conduire à proposer une nouvelle classification.

L’équipe s’attachera à décrire et à comprendre les processus évolutifs à l’origine des interactions passées et actuelles entre les insectes phytophages tropicaux, leurs plantes hôtes sauvages ou cultivées et leurs parasitoïdes. Elle étudie aussi la réponse des insectes phytophages tropicaux aux changements globaux.

Trois thèmes de recherche majeurs seront développés :

* Etude de la diversité des interactions monocotylédones – lépidoptères foreurs – insectes parasitoïdes en Afrique subsaharienne;
* Etude des facteurs à l’origine du succès d’invasions récentes d’insectes phytophages en région tropicale;
* Systématique, hypothèses phylogénétiques et patrons d’interactions entre les insectes phytophages tropicaux et les plantes.

La mémoire chez les drosophiles est au coeur des préoccupations de l’équipe. Les chercheurs utilisent différents types d’apprentissage pour aborder l’étude des capacités cognitives globales des drosophiles. Une thématique nouvelle est la transmission sociale et son implication dans la transmission culturelle d’informations.