{"id":77,"date":"2013-11-20T14:18:07","date_gmt":"2013-11-20T13:18:07","guid":{"rendered":"https:\/\/www.egce.universite-paris-saclay.fr\/?page_id=77"},"modified":"2013-11-20T14:18:07","modified_gmt":"2013-11-20T13:18:07","slug":"elegem","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.egce.universite-paris-saclay.fr\/?page_id=77","title":{"rendered":"ELEGEM"},"content":{"rendered":"

Equipe \u00c9l\u00e9ments G\u00e9n\u00e9tiques Mobiles<\/h2>\n
\n<\/legend>\n

Nos th\u00e9matiques de recherche s’inscrivent dans le cadre de l’\u00e9volution du g\u00e9nome et les interactions qui s’y d\u00e9veloppent. Elles se concentrent principalement sur l’\u00e9tude des s\u00e9quences g\u00e9n\u00e9tiques mobiles, et notamment des \u00e9l\u00e9ments transposables (ET)<\/span><\/a><\/span>, leur dynamique et leur impact dans les g\u00e9nomes et les populations. Les principaux th\u00e8mes abord\u00e9s sont :<\/p>\n

– l’\u00e9volution des \u00e9l\u00e9ments mobiles<\/span>, incluant l’analyse de leur diversit\u00e9, l’identification des facteurs (g\u00e9nomiques ou externes) influen\u00e7ant leur activit\u00e9 (niveau d’expression et niveau de transposition), l’\u00e9volution de la structure g\u00e9n\u00e9rale des \u00e9l\u00e9ments transposables (et de leur proteines), la classification des \u00e9l\u00e9ments.<\/p>\n

– L’impact des \u00e9l\u00e9ments transposables sur les g\u00e9nomes<\/span>, et en particulier, le r\u00f4le de ET dans les transferts lateraux de g\u00e8nes, la dynamique d’invasion des g\u00e9nomes et des populations par un \u00e9l\u00e9ment transposable suite \u00e0 un transfert horizontal (ou une migration), les interactions entre \u00e9l\u00e9ments autonomes et non autonomes.<\/p>\n

– L’\u00e9volution des g\u00e9nomes et des syst\u00e8mes biologiques<\/span> : les interactions entre g\u00e8nes vont d\u00e9terminer les caract\u00e8res. La s\u00e9lection ph\u00e9notypique va agir sur les g\u00e9nomes. Par des approches exp\u00e9rimentales et th\u00e9oriques, nous cherchons \u00e0 comprendre comment des syst\u00e8mes biologiques complexes se sont mis en place, fonctionnent et \u00e9voluent.<\/p>\n

Les approches utilis\u00e9es sont principalement mol\u00e9culaires et bioinformatiques. L’approche biologique utilise comme mod\u00e8le la drosophile (Drosophila melanogaster<\/span> ou D. simulans<\/span>), et l’\u00e9l\u00e9ment transposable mariner<\/span>. Les approches bioinformatiques nous permettent de d\u00e9velopper les outils n\u00e9cessaires \u00e0 l’analyse des g\u00e9nomes, aux simulations de populations<\/p>\n

Mots cl\u00e9s : <\/span>El\u00e9ments transposables, transposons ADN mariner<\/span>, Drosophila melanogaster<\/span>, Drosophila simulans<\/span>, g\u00e9nomique, dynamique \u00e9volutive, \u00e9volution mol\u00e9culaire<\/fieldset>\n

 <\/p>\n

Propositions de stage dans l’\u00e9quipe<\/span><\/a><\/span><\/h3>\n

 <\/p>\n

Les membres de l’\u00e9quipe<\/h2>\n

Chercheurs et Enseignants-chercheurs<\/span><\/h3>\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n
\"Aurelie-carre\"<\/a><\/td>\n\n

Aur\u00e9lie Hua-Van<\/a>
\nResponsable d’\u00e9quipe<\/strong><\/h4>\n

Ma\u00eetre de conf\u00e9rences \u00e0 l’Universit\u00e9 Paris-Sud 11 (Orsay)<\/strong>
\nEvolution mol\u00e9culaire et dynamique \u00e9volutive des \u00e9l\u00e9ments transposables dans les g\u00e9nomes
\nR\u00e9gulation de l’\u00e9l\u00e9ment transposable mariner chez les drosophiles<\/td>\n<\/tr>\n

\"capy[1]\"<\/a><\/td>\n\n

Pierre Capy<\/a>
\nDirecteur du laboratoire <\/strong><\/h4>\n

Professeur \u00e0 l’Universit\u00e9 Paris-Sud (Orsay)<\/strong>;
\nEl\u00e9ment transposable mariner<\/span>.
\nEvolution de la structure des ETs.
\nDynamique d’invasion et maintien sur le long terme des ETs.<\/td>\n<\/tr>\n

\"david\"<\/a><\/td>\n\n

Jean David<\/a><\/strong><\/h4>\n

Directeur de Recherche \u00e9m\u00e9rite du CNRS.Plasticit\u00e9 ph\u00e9notypique<\/strong>
\nTol\u00e9rance \u00e0 la temp\u00e9rature<\/td>\n<\/tr>\n

\"filee\"<\/a><\/td>\n\n

Jonathan Fil\u00e9e<\/a><\/strong><\/h4>\n

Charg\u00e9 de recherche CNRS.
\n<\/strong> G\u00e9nomique \u00e9volutive des virus et transposons
\n<\/strong><\/td>\n<\/tr>\n

\"lerouzic\"<\/a><\/td>\n\n

Arnaud Le Rouzic<\/a><\/strong><\/h4>\n

Charg\u00e9 de recherche CNRS<\/strong>
\nApproches theoriques de l’\u00e9volution des syst\u00e8mes h\u00e9r\u00e9ditaires et de leur evolvabilit\u00e9.<\/td>\n<\/tr>\n

\"Jean-Michel<\/a><\/td>\n\n

Jean-Michel Rossignol<\/a><\/strong><\/h4>\n

Professeur Em\u00e9rite de l’Universit\u00e9 Paris-Sud.<\/strong><\/td>\n<\/tr>\n

\"\"<\/td>\n\n

Jacques-Deric Rouault<\/a><\/strong><\/h4>\n

Charg\u00e9 de recherche CNRS.<\/strong>
\nMod\u00e9lisation, Validation, Scilab.
\nClassification des \u00e9l\u00e9ments transposables mariner<\/span><\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n

Ing\u00e9nieurs et Techniciens<\/span><\/h3>\n\n\n\n\n
\"clavereau2\"<\/a><\/td>\n\n

Isabelle Clavereau<\/a><\/strong><\/h4>\n

Technicienne CNRS.<\/strong>
\nR\u00e9gulation de l’expression des \u00e9l\u00e9ments transposables dans les populations naturelles de Drosophila simulans<\/em>.<\/td>\n<\/tr>\n

\"ELEGEM_Robillard\"<\/a><\/td>\n\n

Emilie Robillard<\/a><\/strong><\/h4>\n

Technicienne CNRS<\/strong>
\nActivit\u00e9 et r\u00e9gulation de l’\u00e9l\u00e9ment transposable mariner<\/span> dans Drosophila melanogaster.<\/span>
\nDynamique d’invasion dans les populations de Drosophila melanogaster<\/span> de l’\u00e9l\u00e9ment transposable mariner<\/span>.
\nComp\u00e9tition entre copies.<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n

\u00c9tudiants<\/span><\/h3>\n\n\n\n\n\n
\"\"<\/td>\n\n

Bastien Saint-Leandre<\/a><\/strong><\/h4>\n

Doctorant de l’Ecole Doctorale \u00ab\u00a0G\u00e8nes, G\u00e9nomes, Cellules\u00a0\u00bb (Universit\u00e9 Paris-Sud)<\/strong>
\nR\u00e9gulation de l’\u00e9l\u00e9ment mariner chez les drosophiles.<\/td>\n<\/tr>\n

\"\"<\/td>\n\n

Gabriel Da Luz Wallau<\/a><\/strong><\/h4>\n

Doctorant de l’Universit\u00e9 F\u00e9d\u00e9rale de Santa Maria – BRESIL<\/strong>
\nEvolution des \u00e9l\u00e9ments mariner dans les genomes s\u00e9quenc\u00e9s de drosophiles.<\/td>\n<\/tr>\n

\"photo<\/a><\/td>\n\n

Estelle R\u00fcnneburger<\/a><\/strong><\/h4>\n

Doctorante de l’Ecole Doctorale \u00ab\u00a0G\u00e8nes, G\u00e9nomes, Cellules\u00a0\u00bb (Universit\u00e9 Paris-Sud)<\/strong>
\nEvolution des r\u00e9seaux de g\u00e8nes. Causes et cons\u00e9quences de l’\u00e9volution du ph\u00e9notype.<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n

Anciens \u00c9tudiants<\/span><\/h3>\n\n\n\n\n
\"\"<\/td>\n\n

Thibaud Boutin<\/a><\/strong><\/h4>\n

Doctorant de l’Ecole Doctorale \u00ab\u00a0G\u00e8nes, G\u00e9nomes, Cellules\u00a0\u00bb (Universit\u00e9 Paris-Sud)<\/strong>
\nDynamique d’invasion et maintien sur le long terme des ETs.
\nTh\u00e8se soutenue le 16 septembre 2010<\/td>\n<\/tr>\n

\"\"<\/td>\n\n

Sophie Picot<\/a><\/strong><\/h4>\n

Doctorante de l’\u00e9cole doctorale, \u00ab\u00a0G\u00e8nes, G\u00e9nomes, Cellules\u00a0\u00bb (Universit\u00e9 Paris-Sud)<\/strong>
\nActivity of the transposable element mariner<\/span> in natural populations of Drosophila simulans <\/i>
\nTh\u00e8se soutenue en 2008<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n

<\/a><\/p>\n

Qu’est ce qu’un \u00e9l\u00e9ment transposable ?<\/h2>\n

Les \u00e9l\u00e9ments transposables sont des entit\u00e9s g\u00e9n\u00e9tiques souvent consid\u00e9r\u00e9es comme des parasites g\u00e9nomiques, du fait qu\u2019ils peuvent se r\u00e9pliquer plus rapidement que le g\u00e9nome qui les porte. La transposition de nouvelles copies d\u2019\u00e9l\u00e9ments transposables dans de nouveaux sites g\u00e9nomiques, ou la recombinaison ectopique entre copies, peut avoir des effets d\u00e9l\u00e9t\u00e8res \u00e9vidents sur le fonctionnement du g\u00e9nome et des g\u00e8nes. Les \u00e9l\u00e9ments transposables restent n\u00e9anmoins une force \u00e9volutive majeure, en augmentant la diversit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique, favorisant ainsi l\u2019adaptabilit\u00e9 des g\u00e9nomes.<\/p>\n

Comme tous les g\u00e8nes classiques, les \u00e9l\u00e9ments transposables sont soumis \u00e0 des r\u00e9gulations diverses qui vont limiter le nombre de copies dans le g\u00e9nome et dans les populations, et contrebalancer ainsi l\u2019augmentation du nombre de copies li\u00e9e \u00e0 la transposition. De plus, le nombre de copies est lui-m\u00eame soumis \u00e0 s\u00e9lection, d\u00e8s lors que le fardeau g\u00e9n\u00e9tique devient trop lourd.<\/p>\n

Comme tous les g\u00e8nes classiques, les s\u00e9quences des \u00e9l\u00e9ments transposables \u00e9voluent. Toutefois, la s\u00e9lection purifiante pour conserver une prot\u00e9ine fonctionnelle est moins forte, la transposition d\u2019une copie pouvant \u00eatre r\u00e9alis\u00e9e gr\u00e2ce aux enzymes fabriqu\u00e9es \u00e0 partir d\u2019une autre copie (transposition en trans<\/i>). Ainsi, de nombreuses copies inactives ou d\u00e9l\u00e9t\u00e9es peuvent s\u2019accumuler, et m\u00eame s\u2019amplifier. Il en r\u00e9sulte ainsi une comp\u00e9tition entre copies d\u2019un m\u00eame \u00e9l\u00e9ment, qui s\u2019ajoute \u00e0 la comp\u00e9tition entre familles diff\u00e9rentes dans un m\u00eame g\u00e9nome.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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